Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 MSANTD2-207ENST00000634413 599 ntTSL 523.41■■□□□ 1.341e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MSANTD2-205ENST00000527140 775 ntTSL 323.41■■□□□ 1.341e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.331e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TAZ-224ENST00000621647 986 ntTSL 223.35■■□□□ 1.331e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RNASEH2C-205ENST00000531596 968 ntTSL 323.33■■□□□ 1.321e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.311e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-242ENST00000639608 2457 ntTSL 523.24■■□□□ 1.311e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FGFR4-214ENST00000513166 594 ntTSL 423.16■■□□□ 1.31e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.291e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PAPSS1-202ENST00000502431 903 ntTSL 523.06■■□□□ 1.281e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CAPN1-220ENST00000530567 1415 ntTSL 223.02■■□□□ 1.281e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CYFIP2-217ENST00000611075 1000 ntTSL 223■■□□□ 1.271e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.271e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FGFR4-212ENST00000510911 709 ntTSL 422.94■■□□□ 1.261e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FGFR4-209ENST00000507708 476 ntTSL 322.94■■□□□ 1.261e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.262e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.261e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CAPN10-206ENST00000391983 2320 ntTSL 1 (best)22.83■■□□□ 1.251e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.241e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.241e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CD99-208ENST00000482405 842 ntTSL 222.76■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.231e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CWC15-203ENST00000542165 921 ntTSL 1 (best)22.64■■□□□ 1.221e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SCYL1-209ENST00000528545 981 ntTSL 522.62■■□□□ 1.211e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PDLIM4-205ENST00000463615 582 ntTSL 222.61■■□□□ 1.211e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.21e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SERPINH1-211ENST00000529643 660 ntTSL 322.5■■□□□ 1.192e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-210ENST00000473122 1085 ntTSL 522.49■■□□□ 1.191e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PDLIM4-206ENST00000474421 1084 ntTSL 322.43■■□□□ 1.181e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RNASEK-C17orf49-203ENST00000549775 1856 ntTSL 522.41■■□□□ 1.181e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-213ENST00000451231 2163 ntTSL 222.35■■□□□ 1.171e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.161e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PMS1-211ENST00000424766 831 ntTSL 322.26■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ANKMY1-205ENST00000391988 569 ntTSL 522.25■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-210ENST00000438091 1208 ntTSL 522.24■■□□□ 1.151e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.141e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.141e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 COTL1-204ENST00000564662 713 ntTSL 222.18■■□□□ 1.141e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 STX10-206ENST00000588848 1164 ntTSL 222.18■■□□□ 1.141e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.142e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CNPPD1-203ENST00000451647 919 ntTSL 322.14■■□□□ 1.141e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 KTN1-221ENST00000555498 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.13■■□□□ 1.131e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CDK2AP1-202ENST00000535796 344 ntTSL 222.11■■□□□ 1.132e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.131e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TOLLIP-210ENST00000530506 1297 ntTSL 522.07■■□□□ 1.121e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.121e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.11e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.11e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 BCAP31-204ENST00000429550 684 ntTSL 321.9■■□□□ 1.11e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ARFGAP2-227ENST00000533243 1558 ntTSL 221.9■■□□□ 1.11e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.091e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PAXIP1-204ENST00000457196 3990 ntTSL 521.82■■□□□ 1.081e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.071e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CAPN10-201ENST00000270361 2453 ntTSL 1 (best)21.74■■□□□ 1.071e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ARHGEF1-217ENST00000598812 588 ntTSL 521.72■■□□□ 1.071e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FBXW5-207ENST00000487794 1932 ntTSL 1 (best)21.66■■□□□ 1.062e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 STAT5A-204ENST00000469124 562 ntTSL 221.66■■□□□ 1.061e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PUS1-206ENST00000537484 642 ntTSL 321.58■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ATPAF2-212ENST00000584205 1298 ntTSL 221.57■■□□□ 1.041e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TMC7-204ENST00000568469 1617 ntTSL 221.53■■□□□ 1.041e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-221ENST00000638542 2168 ntTSL 521.51■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-211ENST00000484728 588 ntTSL 221.49■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TAF4-203ENST00000474089 532 ntTSL 221.45■■□□□ 1.021e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 STX10-203ENST00000440593 940 ntTSL 521.41■■□□□ 1.021e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TOX3-205ENST00000568436 548 ntTSL 321.38■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-226ENST00000638855 2180 ntTSL 521.33■■□□□ 11e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 12e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 HDAC10-212ENST00000477814 1784 ntTSL 221.3■■□□□ 11e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PLBD1-203ENST00000541618 857 ntTSL 521.29■■□□□ 11e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.991e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 AATF-202ENST00000613840 648 ntTSL 221.26■□□□□ 0.991e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.991e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PSMD7-206ENST00000568717 1395 ntTSL 221.22■□□□□ 0.991e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.991e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SCRN2-213ENST00000584567 932 ntTSL 221.18■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.981e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 TUSC2-206ENST00000463304 475 ntTSL 221.16■□□□□ 0.981e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.981e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.981e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-209ENST00000436503 1445 ntTSL 1 (best)21.11■□□□□ 0.971e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 NAGK-221ENST00000497690 553 ntTSL 221.08■□□□□ 0.971e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 SCARF1-204ENST00000570902 1060 ntTSL 1 (best)21.08■□□□□ 0.972e-14■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.971e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.961e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CAPN10-209ENST00000416591 2514 ntTSL 1 (best)21.04■□□□□ 0.961e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PLAGL1-215ENST00000626462 587 ntTSL 421.01■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 ST3GAL5-235ENST00000639305 2160 ntTSL 520.99■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-214ENST00000451271 2284 ntTSL 1 (best)20.98■□□□□ 0.951e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 PLAGL1-213ENST00000626294 593 ntTSL 1 (best)20.95■□□□□ 0.941e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.941e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 IL17RC-230ENST00000498214 2346 ntTSL 220.89■□□□□ 0.931e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.931e-7■■■■■ 172.3
SF3B1O75533 CHCHD6-207ENST00000514908 713 ntTSL 320.86■□□□□ 0.931e-7■■■■■ 172.3
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 293.4 ms