Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NIPSNAP2O75323 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NIPSNAP2O75323 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms