Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH16O75309 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDH16O75309 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDH16O75309 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDH16O75309 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDH16O75309 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH16O75309 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH16O75309 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH16O75309 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH16O75309 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH16O75309 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH16O75309 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH16O75309 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH16O75309 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH16O75309 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH16O75309 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH16O75309 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH16O75309 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDH16O75309 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH16O75309 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH16O75309 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH16O75309 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH16O75309 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH16O75309 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH16O75309 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH16O75309 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH16O75309 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH16O75309 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH16O75309 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH16O75309 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH16O75309 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDH16O75309 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH16O75309 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH16O75309 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH16O75309 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH16O75309 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH16O75309 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH16O75309 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH16O75309 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH16O75309 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH16O75309 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDH16O75309 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH16O75309 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH16O75309 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH16O75309 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH16O75309 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH16O75309 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH16O75309 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH16O75309 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH16O75309 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH16O75309 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH16O75309 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH16O75309 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH16O75309 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH16O75309 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH16O75309 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH16O75309 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH16O75309 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH16O75309 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH16O75309 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH16O75309 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH16O75309 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH16O75309 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH16O75309 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH16O75309 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH16O75309 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH16O75309 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH16O75309 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH16O75309 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH16O75309 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH16O75309 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH16O75309 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH16O75309 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH16O75309 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH16O75309 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH16O75309 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH16O75309 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH16O75309 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH16O75309 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH16O75309 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH16O75309 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDH16O75309 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH16O75309 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH16O75309 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH16O75309 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH16O75309 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH16O75309 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH16O75309 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH16O75309 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH16O75309 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH16O75309 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH16O75309 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH16O75309 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH16O75309 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH16O75309 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH16O75309 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH16O75309 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH16O75309 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH16O75309 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH16O75309 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms