Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VEGFDO43915 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VEGFDO43915 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VEGFDO43915 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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