Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KIF1CO43896 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIF1CO43896 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KIF1CO43896 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms