Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP9O43818 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP9O43818 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP9O43818 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP9O43818 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP9O43818 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP9O43818 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP9O43818 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP9O43818 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP9O43818 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP9O43818 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP9O43818 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP9O43818 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP9O43818 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RRP9O43818 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP9O43818 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP9O43818 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP9O43818 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP9O43818 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP9O43818 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP9O43818 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP9O43818 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP9O43818 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP9O43818 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP9O43818 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP9O43818 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP9O43818 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP9O43818 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP9O43818 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP9O43818 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP9O43818 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP9O43818 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP9O43818 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP9O43818 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP9O43818 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP9O43818 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP9O43818 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP9O43818 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP9O43818 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP9O43818 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP9O43818 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP9O43818 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP9O43818 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP9O43818 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP9O43818 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP9O43818 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP9O43818 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP9O43818 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP9O43818 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP9O43818 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP9O43818 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP9O43818 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP9O43818 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP9O43818 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP9O43818 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP9O43818 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP9O43818 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP9O43818 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP9O43818 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP9O43818 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP9O43818 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP9O43818 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP9O43818 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP9O43818 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP9O43818 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP9O43818 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP9O43818 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP9O43818 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP9O43818 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP9O43818 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP9O43818 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP9O43818 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP9O43818 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP9O43818 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP9O43818 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP9O43818 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP9O43818 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP9O43818 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP9O43818 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP9O43818 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP9O43818 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP9O43818 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP9O43818 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP9O43818 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP9O43818 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP9O43818 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP9O43818 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP9O43818 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP9O43818 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP9O43818 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP9O43818 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP9O43818 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP9O43818 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP9O43818 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP9O43818 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP9O43818 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP9O43818 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP9O43818 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP9O43818 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP9O43818 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms