Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TIMM44O43615 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM44O43615 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms