Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCXO43602 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCXO43602 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCXO43602 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCXO43602 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCXO43602 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCXO43602 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCXO43602 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCXO43602 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCXO43602 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCXO43602 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCXO43602 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DCXO43602 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCXO43602 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DCXO43602 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCXO43602 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCXO43602 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCXO43602 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCXO43602 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCXO43602 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCXO43602 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCXO43602 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCXO43602 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCXO43602 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCXO43602 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCXO43602 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCXO43602 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCXO43602 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCXO43602 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCXO43602 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCXO43602 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCXO43602 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCXO43602 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCXO43602 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCXO43602 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCXO43602 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCXO43602 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DCXO43602 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCXO43602 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCXO43602 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCXO43602 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCXO43602 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCXO43602 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCXO43602 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCXO43602 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCXO43602 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCXO43602 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCXO43602 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCXO43602 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCXO43602 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCXO43602 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCXO43602 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DCXO43602 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCXO43602 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCXO43602 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCXO43602 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCXO43602 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCXO43602 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCXO43602 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCXO43602 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCXO43602 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCXO43602 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCXO43602 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCXO43602 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCXO43602 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCXO43602 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCXO43602 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCXO43602 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCXO43602 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCXO43602 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCXO43602 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCXO43602 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCXO43602 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCXO43602 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCXO43602 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCXO43602 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCXO43602 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCXO43602 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCXO43602 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCXO43602 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms