Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COCHO43405 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COCHO43405 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COCHO43405 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COCHO43405 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COCHO43405 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COCHO43405 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COCHO43405 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COCHO43405 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COCHO43405 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COCHO43405 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COCHO43405 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COCHO43405 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COCHO43405 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COCHO43405 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COCHO43405 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COCHO43405 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COCHO43405 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COCHO43405 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COCHO43405 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COCHO43405 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COCHO43405 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COCHO43405 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COCHO43405 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COCHO43405 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COCHO43405 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COCHO43405 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COCHO43405 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COCHO43405 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COCHO43405 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COCHO43405 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COCHO43405 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COCHO43405 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COCHO43405 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COCHO43405 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COCHO43405 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COCHO43405 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COCHO43405 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COCHO43405 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COCHO43405 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COCHO43405 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COCHO43405 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COCHO43405 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COCHO43405 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COCHO43405 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COCHO43405 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COCHO43405 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COCHO43405 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COCHO43405 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COCHO43405 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COCHO43405 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COCHO43405 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COCHO43405 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COCHO43405 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COCHO43405 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COCHO43405 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COCHO43405 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COCHO43405 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COCHO43405 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COCHO43405 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COCHO43405 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
COCHO43405 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COCHO43405 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COCHO43405 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COCHO43405 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COCHO43405 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COCHO43405 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COCHO43405 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COCHO43405 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COCHO43405 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COCHO43405 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COCHO43405 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COCHO43405 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COCHO43405 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COCHO43405 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COCHO43405 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COCHO43405 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COCHO43405 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COCHO43405 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COCHO43405 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COCHO43405 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COCHO43405 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COCHO43405 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COCHO43405 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COCHO43405 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COCHO43405 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COCHO43405 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COCHO43405 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COCHO43405 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COCHO43405 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COCHO43405 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COCHO43405 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COCHO43405 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COCHO43405 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COCHO43405 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COCHO43405 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COCHO43405 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COCHO43405 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COCHO43405 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COCHO43405 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 337.7 ms