Protein–RNA interactions for Protein: O15269

SPTLC1, Serine palmitoyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC1O15269 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPTLC1O15269 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTLC1O15269 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms