Protein–RNA interactions for Protein: O00764

PDXK, Pyridoxal kinase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXKO00764 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXKO00764 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXKO00764 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXKO00764 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXKO00764 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXKO00764 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXKO00764 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXKO00764 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXKO00764 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXKO00764 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXKO00764 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXKO00764 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDXKO00764 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDXKO00764 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDXKO00764 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDXKO00764 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDXKO00764 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDXKO00764 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDXKO00764 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDXKO00764 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDXKO00764 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDXKO00764 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDXKO00764 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDXKO00764 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDXKO00764 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDXKO00764 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDXKO00764 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDXKO00764 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDXKO00764 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDXKO00764 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDXKO00764 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDXKO00764 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDXKO00764 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDXKO00764 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDXKO00764 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDXKO00764 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXKO00764 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXKO00764 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXKO00764 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXKO00764 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXKO00764 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXKO00764 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXKO00764 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXKO00764 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXKO00764 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXKO00764 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXKO00764 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXKO00764 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXKO00764 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDXKO00764 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDXKO00764 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDXKO00764 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDXKO00764 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDXKO00764 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDXKO00764 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDXKO00764 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDXKO00764 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDXKO00764 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDXKO00764 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDXKO00764 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDXKO00764 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDXKO00764 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDXKO00764 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDXKO00764 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDXKO00764 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDXKO00764 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDXKO00764 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDXKO00764 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDXKO00764 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDXKO00764 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDXKO00764 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDXKO00764 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDXKO00764 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDXKO00764 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDXKO00764 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDXKO00764 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDXKO00764 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDXKO00764 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDXKO00764 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDXKO00764 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDXKO00764 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDXKO00764 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDXKO00764 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDXKO00764 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDXKO00764 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDXKO00764 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDXKO00764 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDXKO00764 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDXKO00764 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDXKO00764 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDXKO00764 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDXKO00764 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDXKO00764 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDXKO00764 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDXKO00764 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDXKO00764 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDXKO00764 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDXKO00764 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDXKO00764 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDXKO00764 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms