Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EBAG9O00559 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EBAG9O00559 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EBAG9O00559 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms