Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX39AO00148 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX39AO00148 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms