Protein–RNA interactions for Protein: H0Y354

FAM72C, Protein FAM72C, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM72CH0Y354 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM72CH0Y354 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM72CH0Y354 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms