Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E9PMD0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E9PMD0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E9PMD0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E9PMD0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E9PMD0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E9PMD0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E9PMD0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E9PMD0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E9PMD0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
E9PMD0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
E9PMD0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
E9PMD0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E9PMD0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E9PMD0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E9PMD0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E9PMD0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E9PMD0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E9PMD0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E9PMD0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E9PMD0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
E9PMD0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E9PMD0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E9PMD0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
E9PMD0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E9PMD0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E9PMD0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E9PMD0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
E9PMD0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E9PMD0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E9PMD0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E9PMD0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
E9PMD0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
E9PMD0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E9PMD0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E9PMD0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
E9PMD0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
E9PMD0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
E9PMD0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
E9PMD0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E9PMD0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E9PMD0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E9PMD0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
E9PMD0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
E9PMD0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E9PMD0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E9PMD0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
E9PMD0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
E9PMD0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
E9PMD0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PMD0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PMD0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PMD0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PMD0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PMD0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PMD0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
E9PMD0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PMD0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
E9PMD0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PMD0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PMD0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PMD0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PMD0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PMD0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PMD0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PMD0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PMD0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PMD0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PMD0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PMD0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
E9PMD0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PMD0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PMD0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PMD0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PMD0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PMD0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PMD0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PMD0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PMD0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PMD0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PMD0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PMD0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PMD0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
E9PMD0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PMD0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PMD0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PMD0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PMD0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
E9PMD0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
E9PMD0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
E9PMD0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PMD0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PMD0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PMD0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PMD0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PMD0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PMD0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PMD0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PMD0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
E9PMD0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms