Protein–RNA interactions for Protein: C9JI98

TMEM238, Transmembrane protein 238, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM238C9JI98 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM238C9JI98 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM238C9JI98 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms