Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
B4E1Z4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
B4E1Z4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
B4E1Z4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
B4E1Z4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
B4E1Z4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
B4E1Z4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
B4E1Z4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
B4E1Z4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
B4E1Z4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
B4E1Z4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
B4E1Z4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
B4E1Z4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
B4E1Z4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
B4E1Z4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
B4E1Z4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
B4E1Z4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
B4E1Z4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
B4E1Z4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
B4E1Z4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
B4E1Z4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
B4E1Z4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
B4E1Z4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
B4E1Z4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
B4E1Z4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
B4E1Z4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
B4E1Z4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4E1Z4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4E1Z4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4E1Z4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4E1Z4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
B4E1Z4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4E1Z4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
B4E1Z4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4E1Z4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4E1Z4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4E1Z4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4E1Z4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4E1Z4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4E1Z4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4E1Z4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
B4E1Z4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
B4E1Z4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
B4E1Z4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
B4E1Z4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
B4E1Z4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
B4E1Z4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
B4E1Z4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
B4E1Z4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
B4E1Z4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
B4E1Z4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
B4E1Z4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
B4E1Z4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
B4E1Z4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
B4E1Z4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
B4E1Z4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
B4E1Z4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
B4E1Z4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
B4E1Z4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
B4E1Z4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
B4E1Z4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
B4E1Z4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
B4E1Z4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
B4E1Z4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
B4E1Z4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26■■□□□ 1.75
B4E1Z4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
B4E1Z4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
B4E1Z4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
B4E1Z4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
B4E1Z4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
B4E1Z4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26■■□□□ 1.75
B4E1Z4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
B4E1Z4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
B4E1Z4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
B4E1Z4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
B4E1Z4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
B4E1Z4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
B4E1Z4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
B4E1Z4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
B4E1Z4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
B4E1Z4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
B4E1Z4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4E1Z4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4E1Z4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4E1Z4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4E1Z4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4E1Z4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4E1Z4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4E1Z4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4E1Z4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4E1Z4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4E1Z4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
B4E1Z4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4E1Z4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4E1Z4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4E1Z4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4E1Z4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4E1Z4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
B4E1Z4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
B4E1Z4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms