Protein–RNA interactions for Protein: B2RC85

RSPH10B2, Radial spoke head 10 homolog B2, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH10B2B2RC85 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RSPH10B2B2RC85 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RSPH10B2B2RC85 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH10B2B2RC85 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RSPH10B2B2RC85 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms