Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00587B1AMM8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00587B1AMM8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms