Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CFAP73A6NFT4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CFAP73A6NFT4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms