Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L3A6NEY3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GOLGA6L3A6NEY3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GOLGA6L3A6NEY3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms