Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XIRP2A4UGR9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XIRP2A4UGR9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms