Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A0U1RQJ8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0U1RQJ8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0U1RQJ8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms