Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 MIR4687-201ENST00000583618 80 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 EXTL3-AS1-204ENST00000523789 543 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AC063924.1-201ENST00000546680 673 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AL592295.4-201ENST00000636161 997 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 ALX1-201ENST00000316824 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 RORC-201ENST00000318247 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 STPG4-201ENST00000294947 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AFG3L2P1-201ENST00000521792 1763 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 AC136604.2-201ENST00000500262 1966 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CGNL1Q0VF96 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms