Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 LINC01801-202ENST00000590963 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PLXNA4-203ENST00000378539 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 MIR4687-201ENST00000583618 80 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ZCCHC9-203ENST00000407610 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 HTR4-201ENST00000360693 3082 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CDK8P49336 FHL2-208ENST00000409807 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ZNF662-202ENST00000422021 436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 LINC02151-201ENST00000452629 921 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CDK2AP2P2-201ENST00000478512 367 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ZNF674-AS1-202ENST00000609887 672 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK8P49336 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms