Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 CD44-203ENST00000278386 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 OR2T33-201ENST00000318021 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 CR769775.1-203ENST00000399894 579 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 AC139100.2-201ENST00000616901 662 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 FPR2-203ENST00000598953 1544 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCAMP50895 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 ZFP37-203ENST00000555206 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 CYFIP2-222ENST00000620254 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 FAM76A-202ENST00000234549 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 RNA5SP248-201ENST00000365602 127 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 FAM76A-207ENST00000530324 1027 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCAMP50895 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCAMP50895 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCAMP50895 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCAMP50895 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCAMP50895 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCAMP50895 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BCAMP50895 XYLB-203ENST00000427323 1666 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCAMP50895 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCAMP50895 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCAMP50895 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCAMP50895 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCAMP50895 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCAMP50895 SCN8A-215ENST00000638820 3359 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCAMP50895 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCAMP50895 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCAMP50895 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCAMP50895 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCAMP50895 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCAMP50895 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCAMP50895 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCAMP50895 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCAMP50895 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCAMP50895 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BCAMP50895 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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