Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC026369.2-201ENST00000540136 1101 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SYS1-201ENST00000243918 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 STAT6-203ENST00000537215 2886 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 FOXO4-202ENST00000374259 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ATP6AP1-210ENST00000619046 2823 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SPTLC1-201ENST00000262554 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 NEK6-205ENST00000394199 2535 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 NEFM-204ENST00000518131 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 B4GALT1-201ENST00000379731 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CYTH1-210ENST00000589297 3756 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 PPP3CB-204ENST00000394829 3149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 GOLGA8CP-201ENST00000446144 5237 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 GOLGA8F-201ENST00000526619 5237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC243964.3-201ENST00000623022 2028 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ANKRD30BP2-202ENST00000447861 3260 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 FO681491.1-201ENST00000623586 3260 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 RBFOX1-224ENST00000641259 3651 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 HS6ST2-202ENST00000370836 4441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 LRRC37A7P-201ENST00000583900 2759 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CHPF2-201ENST00000035307 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 OR10H5-202ENST00000642092 7044 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 EME1-201ENST00000338165 2339 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SH3BGRL2-201ENST00000369838 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 AC011899.1-201ENST00000436489 3600 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 MIS18BP1-201ENST00000310806 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 LINC01070-201ENST00000561786 2829 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 SLIT2-201ENST00000273739 5132 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 IFNLR1-201ENST00000327535 4549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ZWILCH-209ENST00000565627 1845 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 RNF207-201ENST00000377939 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ARSJ-201ENST00000315366 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ZNF749-201ENST00000334181 2587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CAMTA2-201ENST00000348066 4491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
SMIM3Q9BZL3 ZNF423-201ENST00000262383 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 FBLN1-203ENST00000340923 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 LARP1-201ENST00000336314 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 ITGB8-205ENST00000537992 3420 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
SMIM3Q9BZL3 NOL10-205ENST00000538384 3418 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
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