Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 PAXIP1-AS2-203ENST00000449486 2121 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 OGDH-203ENST00000439616 2962 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC007622.2-202ENST00000546714 1680 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 BET1-201ENST00000222547 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 SNORA52-201ENST00000362915 134 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AL121761.1-203ENST00000426012 677 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AL731577.1-201ENST00000449984 830 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AL365203.1-201ENST00000450890 1048 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 SAP30L-AS1-202ENST00000519727 396 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 IGLVI-63-201ENST00000524184 384 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 RBP5-202ENST00000542370 564 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AP001453.2-201ENST00000544553 391 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AL118557.1-201ENST00000554408 440 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 KXD1-210ENST00000599000 498 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC018755.1-201ENST00000601315 1182 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC130469.2-201ENST00000625112 1092 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC105219.4-201ENST00000529743 1809 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 SLC25A30-207ENST00000539591 3608 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 OR2C1-201ENST00000304936 1406 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 PRIM1-201ENST00000338193 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AL356583.1-201ENST00000398739 1371 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 GUCY1A3-213ENST00000621234 1788 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 SPACA7-201ENST00000283550 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 LMO7DN-201ENST00000318245 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 FKBP1A-201ENST00000381715 705 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 TRGV4-201ENST00000390345 688 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC007881.1-201ENST00000437460 187 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 C10orf71-AS1-201ENST00000437677 753 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC006372.1-201ENST00000449903 546 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 DEFA8P-201ENST00000457582 285 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC104445.1-201ENST00000460597 749 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC008676.2-201ENST00000519499 741 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 RPS20-208ENST00000521262 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 TMEM253-206ENST00000556585 1236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 LINC02352-201ENST00000557928 468 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 MPI-212ENST00000565576 1148 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 TIMM23-201ENST00000580018 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 LINC00662-204ENST00000588027 562 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 AC092471.1-202ENST00000637160 999 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 C16orf46-202ENST00000378611 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 BARD1-214ENST00000620057 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms