Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 NFATC4-212ENST00000554473 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ZNF684-203ENST00000372699 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PMP22-203ENST00000395938 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK8P49336 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ZNF793-205ENST00000587143 1488 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 DRD3-204ENST00000467632 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AL356130.1-201ENST00000620188 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK8P49336 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CYFIP2-222ENST00000620254 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CR769775.1-203ENST00000399894 579 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AL358876.2-201ENST00000424689 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CITED1-206ENST00000431381 941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CITED1-207ENST00000445983 820 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC073896.3-201ENST00000546789 437 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PROP1-201ENST00000308304 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms