Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 POM121L7P-201ENST00000329949 2404 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 DDX11L2-201ENST00000437401 1398 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TRAF6Q9Y4K3 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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TRAF6Q9Y4K3 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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TRAF6Q9Y4K3 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 RNF113A-201ENST00000371442 1353 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 AC009133.3-201ENST00000565600 1656 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 ZWILCH-209ENST00000565627 1845 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 ZNF529-209ENST00000591340 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 DPYSL2-206ENST00000523027 2130 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 RHOH-221ENST00000615577 2227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 RHOH-223ENST00000619474 2230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAF6Q9Y4K3 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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