Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CPSF4-206ENST00000441580 942 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ODF3BA8MYP8 TTC39A-204ENST00000371750 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PLXNA4-203ENST00000378539 2004 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TGM3-201ENST00000381458 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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