Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ACAD11-204ENST00000481970 1891 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 COX7A2L-202ENST00000378669 3056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 GIMAP1-GIMAP5-201ENST00000611999 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ZCWPW1-208ENST00000490721 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MRFAP1L1-201ENST00000320848 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 HSPA2-201ENST00000247207 2767 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms