Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 FAM9A-201ENST00000381003 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 RETREG3-203ENST00000585894 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 RPS21-202ENST00000370562 1002 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 U3.49-201ENST00000391065 214 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 DMKN-202ENST00000392206 458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AREG-201ENST00000395748 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC010894.2-201ENST00000444196 561 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AL390061.1-201ENST00000457804 293 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 FGL1-206ENST00000518650 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC022733.2-201ENST00000520487 531 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AL162464.2-201ENST00000557761 526 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AC008915.2-201ENST00000570080 730 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 PPP4R1L-201ENST00000244070 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CSF2RA-201ENST00000355432 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
POLD1P28340 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD1P28340 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD1P28340 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD1P28340 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD1P28340 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD1P28340 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD1P28340 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD1P28340 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD1P28340 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD1P28340 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD1P28340 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD1P28340 APTX-206ENST00000379825 2023 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD1P28340 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD1P28340 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD1P28340 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
POLD1P28340 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SNAPC5-203ENST00000395589 749 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 IFITM2-202ENST00000399817 659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 MRPL45P2-201ENST00000425159 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 FTLP16-201ENST00000446400 513 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC121757.1-201ENST00000552441 624 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC137932.2-201ENST00000562995 1205 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SNAPC5-205ENST00000563480 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC091588.2-201ENST00000578741 366 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC007731.1-203ENST00000583722 474 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 FAM230A-201ENST00000615181 315 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 HTR3E-206ENST00000440596 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 IST1-221ENST00000544564 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
POLD1P28340 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
POLD1P28340 S100B-202ENST00000367071 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms