Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 NDUFA3-214ENST00000485876 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 NFXL1-206ENST00000507489 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MST1L-204ENST00000545160 559 ntTSL 4 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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SPOCK3Q9BQ16 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 ITGB2-AS1-204ENST00000609592 482 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC093426.1-201ENST00000561926 3011 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 LBHD1-204ENST00000431002 2915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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SPOCK3Q9BQ16 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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SPOCK3Q9BQ16 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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SPOCK3Q9BQ16 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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SPOCK3Q9BQ16 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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SPOCK3Q9BQ16 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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SPOCK3Q9BQ16 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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SPOCK3Q9BQ16 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SPOCK3Q9BQ16 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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