Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 ALKBH1-201ENST00000216489 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NCAPH2Q6IBW4 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms