Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RUNX2-AS1-201ENST00000563807 1513 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RNF4-201ENST00000314289 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 EGFLAM-202ENST00000336740 3071 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A13-201ENST00000311856 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC126323.1-203ENST00000562306 2579 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FRG2C-201ENST00000308062 2078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FAM213A-201ENST00000372181 2058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FRG2C-202ENST00000464571 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PITX2-213ENST00000616641 3102 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NOP2-207ENST00000537442 2613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC097652.1-201ENST00000511385 2114 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 OLFML2B-203ENST00000367940 2685 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PDIA6-203ENST00000404371 2682 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PEX12-204ENST00000613219 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 WDR24-202ENST00000293883 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ELOVL1-216ENST00000621943 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 FSHR-201ENST00000304421 2176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 IFT81-209ENST00000552912 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF589-201ENST00000354698 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF488-202ENST00000591025 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PARP8-219ENST00000514067 2829 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PATJ-215ENST00000635137 2298 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF700-201ENST00000254321 2882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 RIC3-201ENST00000309737 2859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DHX35-202ENST00000373323 2347 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC026250.1-201ENST00000500698 2311 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJB13-205ENST00000543947 1779 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ELP2-204ENST00000423854 2385 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CWH43-204ENST00000513409 2390 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CAPN3-203ENST00000349748 2955 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PIP5K1A-203ENST00000368890 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 EYA4-208ENST00000452339 2411 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 GJB6-201ENST00000241124 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 IVD-203ENST00000479013 4251 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CENPP-201ENST00000375576 3088 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DNAI2-205ENST00000579490 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 AL118508.3-201ENST00000623468 1854 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF682-202ENST00000397162 3164 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CTNNA2-219ENST00000629316 3167 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CCL24-201ENST00000222902 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms