Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 POM121L9P-201ENST00000414583 5018 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 STRADA-202ENST00000336174 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CCT7P1-201ENST00000406551 1611 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 GDPD2-205ENST00000538649 2067 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PDHA1-206ENST00000422285 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 EME1-201ENST00000338165 2339 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AGO2-205ENST00000519980 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA2P1-201ENST00000512938 2906 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SULT1A2-202ENST00000395630 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC021752.1-202ENST00000613161 2398 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC053503.6-201ENST00000623864 1843 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PAX6-201ENST00000241001 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 DGKH-203ENST00000379274 4202 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 RAET1K-202ENST00000533735 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ARL4A-203ENST00000396663 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 UBE2A-210ENST00000630695 1771 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SCN8A-215ENST00000638820 3359 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 IRF5-208ENST00000473745 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SNU13-203ENST00000401959 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 LRRC8E-206ENST00000618098 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SPATA13-205ENST00000409126 2111 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 AS3MT-201ENST00000369880 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HMGB1P1B2RPK0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms