Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
MAD1L1Q9Y6D9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAD1L1Q9Y6D9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms