Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX10Q9Y5X0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNX10Q9Y5X0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms