Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GTF3C3Q9Y5Q9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms