Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PHLDA3Q9Y5J5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms