Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNIP3Q9Y2W7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNIP3Q9Y2W7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms