Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L8

ZKSCAN5, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 5, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN5Q9Y2L8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZKSCAN5Q9Y2L8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZKSCAN5Q9Y2L8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZKSCAN5Q9Y2L8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZKSCAN5Q9Y2L8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZKSCAN5Q9Y2L8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZKSCAN5Q9Y2L8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZKSCAN5Q9Y2L8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZKSCAN5Q9Y2L8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZKSCAN5Q9Y2L8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZKSCAN5Q9Y2L8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZKSCAN5Q9Y2L8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZKSCAN5Q9Y2L8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZKSCAN5Q9Y2L8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZKSCAN5Q9Y2L8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZKSCAN5Q9Y2L8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZKSCAN5Q9Y2L8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZKSCAN5Q9Y2L8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZKSCAN5Q9Y2L8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZKSCAN5Q9Y2L8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZKSCAN5Q9Y2L8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZKSCAN5Q9Y2L8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZKSCAN5Q9Y2L8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZKSCAN5Q9Y2L8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZKSCAN5Q9Y2L8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZKSCAN5Q9Y2L8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZKSCAN5Q9Y2L8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZKSCAN5Q9Y2L8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZKSCAN5Q9Y2L8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZKSCAN5Q9Y2L8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZKSCAN5Q9Y2L8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZKSCAN5Q9Y2L8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZKSCAN5Q9Y2L8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZKSCAN5Q9Y2L8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms