Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP20Q9Y2K6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP20Q9Y2K6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms