Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y262

EIF3L, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3LQ9Y262 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EIF3LQ9Y262 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EIF3LQ9Y262 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms