Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTNND2Q9UQB3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTNND2Q9UQB3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms