Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SNX6Q9UNH7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SNX6Q9UNH7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms