Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYNRGQ9UMZ2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNRGQ9UMZ2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms