Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULX5

RNF112, RING finger protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF112Q9ULX5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RNF112Q9ULX5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF112Q9ULX5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF112Q9ULX5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms