Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSR3Q9UJK0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TSR3Q9UJK0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSR3Q9UJK0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSR3Q9UJK0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSR3Q9UJK0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSR3Q9UJK0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSR3Q9UJK0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSR3Q9UJK0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TSR3Q9UJK0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms